勤怠管理システムおすすめ7選を比較|料金・無料・中小企業向けの選び方

中小企業向け勤怠管理システム比較7選

こんにちは、SkillStack Lab運営者のスタックです。

勤怠管理システムを比較していて、「無料で使える製品で足りるのか」「10人や30人なら月額はいくらか」「シフト勤務や直行直帰にはどれが合うのか」と迷っていませんか。

結論から言うと、従業員数だけでなく、勤務形態・例外処理・給与計算までの流れから選ぶことが重要です。

勤務時間がほぼ固定され、打刻修正や残業申請も少なく、毎月の勤怠締めに困っていなければ、Excelや無料プランを継続できる会社もあります。

一方、打刻漏れの確認、シフト変更、残業・休暇申請、給与ソフトへの転記に時間がかかっているなら、クラウド勤怠へ移行する効果を感じやすくなります。

この記事では、地方中小企業の管理部門長・元社内SEの視点から、中小企業が比較しやすい勤怠管理システム7製品を、料金・無料利用・勤務形態・給与連携で比較します。

中小企業が自社に合う勤怠管理システムを選ぶための判断基準

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特定の製品だけを一律におすすめするのではなく、Excelや無料プランを続けられるケース、Relix勤怠以外が向くケースも含めて比較します。

料金、無料プラン、無料トライアル、機能、契約条件は変更される場合があります。本記事は2026年8月14日時点で確認できる公開情報をもとにしています。導入前に各社公式サイトと見積書で最新条件を確認してください。

7製品の選び方を先に確認
  • 30名以下で基本機能を無料から使う:HRMOS勤怠
  • 現場・直行直帰・交通費・日報:Relix勤怠
  • 複雑な勤務制度や複数拠点:KING OF TIME
  • 必要な勤怠機能を選んで契約:ジョブカン勤怠管理
  • 勤怠から給与計算へつなぐ:freee勤怠管理
  • 会計・給与などもまとめる:マネーフォワード クラウド勤怠
  • 人事・給与を同じデータベースで管理:ジンジャー勤怠

→ 7製品の比較表へ移動する

目次

勤怠管理システムを選ぶ前の判断基準

勤怠管理システムは、価格表を上から比較するだけでは選べません。

特に重要なのは、従業員数より勤務形態と例外処理の多さです。

同じ10名でも、全員が平日9時〜18時で勤務する会社と、夜勤・シフト・直行直帰・在宅勤務が混在する会社では、勤怠管理の難易度が大きく異なります。

勤務形態や給与計算までの流れから勤怠管理システムを選ぶポイント
確認項目 整理する内容
人数 正社員だけでなくパート・アルバイト・短期スタッフも含める
勤務形態 固定勤務、シフト、夜勤、フレックス、在宅、直行直帰
打刻 PC、スマホ、ICカード、共有端末、GPS
申請・承認 残業、休暇、休日出勤、打刻修正、代理承認
給与連携 給与ソフト、必要なCSV項目、直接連携
運用 初期設定や月末締めを誰が担当するか
総コスト 月額だけでなく端末・設定・教育・毎月の作業時間も含める

Excelを続けてもよい会社

  • 勤務時間と休憩時間がほぼ統一されている
  • 打刻修正や残業申請が少ない
  • 月末の勤怠締めが短時間で終わる
  • 給与ソフトへの転記ミスがほとんどない
  • 担当者以外でも処理できる

この状態なら、月額料金を払ってシステム化する効果が小さい場合もあります。

ただし、Excel自体に追加料金がかからなくても、回収、確認、数式修正、転記には人件費がかかっています。

Excelを続ける限界は、勤怠管理をExcelで続ける限界と7つの移行サインで詳しく整理しています。

クラウド勤怠へ移行したいサイン

  • 月末に打刻漏れを目視で探している
  • 残業や休暇を紙・メール・チャットで申請している
  • 勤怠データを給与ソフトへ手入力している
  • 有給休暇の残数が担当者しか分からない
  • シフト変更が個別メッセージで届く
  • 担当者が休むと勤怠締めが止まる
  • 複数拠点や直行直帰の勤務状況を確認しにくい
Excel勤怠からクラウド勤怠へ移行するタイミングを判断するフローチャート

厚生労働省は、使用者が労働日ごとの始業・終業時刻を確認・記録し、原則として現認やタイムカード、ICカード、パソコン使用時間などの客観的記録を基礎に確認する考え方を示しています。

厚生労働省「労働時間の適正な把握方法」を確認する

勤怠管理システムを導入しただけで法令対応が完了するわけではありません。就業規則、勤務区分、残業、休日、休暇などの設定は自社の制度と一致させ、必要に応じて社会保険労務士などへ確認してください。

中小企業向け勤怠管理システム7製品を比較

2026年8月14日時点で公開されている料金を中心に比較します。

すべて税抜の目安です。オプション、端末、初期設定、導入支援などは別途確認してください。

製品 公開料金の目安 無料利用 向いている会社
Relix勤怠 10名3,000円
30名8,500円
最大2か月 現場・直行直帰・交通費・日報
HRMOS勤怠 30名以下は基本無料
31名以上100円/人〜
無料プランあり 少人数で基本勤怠から始める
KING OF TIME 300円/人 30日無料体験 複雑な勤務制度・複数拠点
ジョブカン勤怠管理 200〜500円/人
最低2,000円
無料プランあり 必要機能を組み合わせる
freee勤怠管理 300円/人 無料お試しあり 給与計算までfreeeでつなぐ
マネーフォワード クラウド勤怠 法人ビジネス
6,480円〜
1か月無料 会計・給与などもまとめる
ジンジャー勤怠 300円/人〜 1か月無料 人事・給与も一元管理する

HRMOS勤怠は31名以上が1人100円からですが、有料プランには月額3,000円・年額33,000円の最低利用料金が設定されています。有給休暇管理や届出申請などのオプションも含め、実際の総額を料金シミュレーターで確認してください。

10名・30名で使った場合の月額料金

人数課金だけで比較できる製品について、10名・30名で利用した場合の目安を整理します。

製品 10名 30名 注意点
Relix勤怠 3,000円 8,500円 人数別プラン
HRMOS勤怠 0円 0円 基本機能。オプションは別
KING OF TIME 3,000円 9,000円 300円×利用人数
ジョブカン 2,000〜5,000円 6,000〜15,000円 利用機能数で変動
freee勤怠管理 3,000円 9,000円 勤怠管理プラン
マネーフォワード 7,980円 13,980円 法人ビジネス年払い+勤怠従量分で試算
ジンジャー勤怠 3,000円〜 9,000円〜 初期費用・契約製品は別途見積もり

この表だけを見ると無料または低価格の製品が有利に見えます。

しかし、実際には給与ソフトへの転記、打刻漏れ確認、シフト作成、問い合わせ対応に残る時間まで比較してください。

月額料金が3,000円安くても、管理担当者が毎月5時間多く作業するなら、会社全体では安いとは限りません。システム利用料と人件費をセットで比較することが重要です。

勤怠管理システムは月額料金だけでなく確認や転記にかかる人件費も比較する

おすすめ勤怠管理システム7選

Relix勤怠|直行直帰・交通費・日報までまとめる

Relix勤怠は、スマートフォンを利用する現場勤務や直行直帰が多い会社と相性があります。

PC・スマートフォンからのWeb打刻に加え、GPS、シフト、交通費申請、日報報告、CSV出力などが用意されています。

10アカウント 月額3,000円
30アカウント 月額8,500円
50アカウント 月額13,750円
無料期間 登録月+翌月の最大2か月
初期費用 0円
  • 営業・派遣・イベントなど現場が分散している
  • 直行直帰をスマホで打刻したい
  • 勤怠と交通費をまとめたい
  • 日報も同じ画面で確認したい
  • 月末締めまで長めに試したい

無料トライアルではクレジットカード等の登録は不要と案内されています。

Relix勤怠は、解約するとそれまでのデータが削除されると特定商取引法表示に記載されています。試用を終了する場合も、必要な勤怠データを事前に出力できるか確認してください。

Relix勤怠公式の料金を確認する

\ 現場勤務・直行直帰なら実際の運用で確認 /

HRMOS勤怠|30名以下なら基本機能を無料で利用

HRMOS勤怠は、システムへの登録人数が30名以下なら基本的な勤怠管理を無料で利用できます。

31名以上は基本機能が1人月額100円からです。

  • まず費用をかけずクラウド打刻へ移行したい
  • 30名以下の会社・店舗
  • PC・スマホ・ICカードなどを使いたい
  • 自社で初期設定や運用を進められる

無料プランではデータ保存期間などに制限があります。また、有給休暇管理・届出申請などを追加すると有料になるため、「無料で何ができるか」だけでなく「自社で必要な機能まで含めるといくらか」を確認してください。

HRMOS勤怠公式の料金を確認する

無料ツールを会社で使う際の注意点は、無料勤怠管理アプリの注意点と選び方でも解説しています。

KING OF TIME|勤務制度が複雑な会社

KING OF TIMEは、初期費用0円、1人月額300円の料金体系です。

PC、スマートフォン、ICカードなどの打刻や、多様な勤務形態への対応を重視する会社が比較しやすい製品です。

  • 正社員・パート・アルバイトが混在している
  • 店舗・工場・本社など複数拠点がある
  • シフトやフレックスなど複数の勤務制度がある
  • 勤怠だけでなく人事労務・給与まで同じシリーズで検討したい

30日間の無料体験が用意されています。ICカードリーダーなどの機器を利用する場合は、端末費用も含めて比較してください。

KING OF TIME公式の料金を確認する

ジョブカン勤怠管理|必要な機能を選んで使う

ジョブカン勤怠管理は、出勤管理、シフト管理、休暇・申請管理、工数管理から必要な機能を組み合わせる料金体系です。

1機能なら1人月額200円で、機能を追加すると最大500円です。月額最低利用料金は2,000円です。

  • 最初は出退勤だけ導入したい
  • 必要に応じてシフトや休暇管理を追加したい
  • 店舗などシフト勤務が多い
  • 部署ごとに必要な機能が異なる

「200円だから安い」と判断せず、最終的に利用する機能をすべて選択した状態で月額を比較してください。

ジョブカン公式の料金を確認する

freee勤怠管理|勤怠から給与までつなげたい会社

freee勤怠管理の勤怠管理プランは1人月額300円です。

給与計算や入退社手続きまで含むスタンダードプランは1人月額800円と案内されています。

  • freee会計・freee人事労務を利用している
  • 勤怠から給与計算までつなげたい
  • スマホ・PC・ICカードなど複数の打刻を使いたい
  • 希望シフトの回収もクラウド化したい

勤怠だけを導入するのか、人事労務全体をfreeeへ統合するのかで費用対効果が変わります。

freee勤怠管理公式の料金を確認する

マネーフォワード クラウド勤怠|バックオフィス全体をまとめる

マネーフォワード クラウド勤怠は、勤怠単体の定額プランではなく、会計、給与、経費など複数サービスを含む基本プランの中で利用します。

法人向けビジネスプランは、年払いで月額換算6,480円です。

勤怠は5名まで基本料金に含まれ、6名目から1人月額300円が加算されます。

  • すでにマネーフォワード クラウドを利用している
  • 勤怠だけでなく会計・給与・経費も見直したい
  • 従業員情報の二重入力を減らしたい

1か月無料トライアルがあり、クレジットカード登録なしで利用でき、終了後に自動で有料契約へ移行しないと案内されています。

マネーフォワード クラウド勤怠公式の料金を確認する

ジンジャー勤怠|人事・給与と同じデータを使いたい会社

ジンジャーは、利用する製品と利用人数によって料金が決まり、公開料金は1人月額300円からです。

勤怠だけでなく、人事労務や給与計算を同じ人事データベースで管理できる点が特徴です。

  • 勤怠と人事情報を一元化したい
  • 将来的に給与まで統合したい
  • 直行直帰やGPS打刻を利用したい
  • 導入時に担当者へ相談しながら進めたい

1か月の無料トライアルがあり、トライアル終了後に自動で有料へ切り替わらないと案内されています。

ただし、初期費用や複数製品を組み合わせた場合の総額は見積もりで確認してください。

ジンジャー公式の料金を確認する

勤務形態別に選ぶならどれ?

固定勤務、シフト勤務、直行直帰など勤務形態ごとに勤怠管理システムを選ぶ図
勤務形態・目的 比較候補 重点確認
少人数・固定勤務 HRMOS、Relix、KING OF TIME 基本打刻・CSV
シフト勤務 ジョブカン、KING OF TIME、HRMOS 希望回収・シフト変更
直行直帰・現場 Relix、freee、ジンジャー スマホ・GPS・交通費
複雑な勤務制度 KING OF TIME、ジョブカン、ジンジャー 勤務区分・集計設定
給与まで統合 freee、マネーフォワード、ジンジャー 従業員マスタ・給与連携

シフト勤務は「打刻」よりシフト作成を見る

飲食、小売、介護などでは、打刻をクラウド化するだけでは十分ではありません。

希望シフトの回収、確定シフトの共有、変更履歴までシステム化できるか確認してください。

希望をLINEで集め、管理者がExcelへ転記する状態が残ると、勤怠システムを導入してもシフト担当者の負担は減りません。

チャットで勤怠を管理する問題は、LINEでの勤怠管理のリスクとクラウド移行で詳しく解説しています。

直行直帰はGPSだけでなく運用ルールも決める

スマートフォンの位置情報を利用する場合は、取得するタイミング、目的、閲覧できる管理者なども決めてください。

「GPS対応」という機能だけで選ばず、従業員にどのように説明し、どの場面で位置情報を取得するかまで運用へ落とし込みましょう。

給与連携は項目単位で確認する

「給与ソフトと連携できます」という説明だけで判断しないことも重要です。

所定内、時間外、深夜、休日、欠勤、遅刻早退など、自社が給与計算へ渡している項目を洗い出してください。

直接連携がなくても、現在使っている給与ソフトへそのまま取り込めるCSVを作成できれば、手入力を減らせる場合があります。

無料プランと無料トライアルは別物

勤怠管理システムの無料プランと無料トライアルの違い
種類 意味 確認点
無料プラン 条件内なら継続して0円 人数・機能・保存期間・サポート
無料トライアル 一定期間だけ試用 終了日・自動課金・データ保持
初期費用0円 導入時の費用が不要 月額・端末・支援費用は別

無料プランで打刻だけできても、有給休暇、残業申請、給与転記を別の仕組みで続けるなら、管理業務が分断されます。

無料かどうかではなく、現在の手作業を何時間減らせるかで判断してください。

無料トライアルで確認したい10項目

無料トライアルでは、管理者がログインして画面を眺めるだけでは不十分です。

  • 従業員を一括登録できるか
  • 従業員が迷わず打刻できるか
  • 打刻漏れや重複を発見しやすいか
  • 残業・休暇・修正を申請できるか
  • 代理承認や複数承認者を設定できるか
  • 深夜・休日・欠勤などを正しく集計できるか
  • 給与計算に必要な項目を出力できるか
  • 過去データを出力・保管できるか
  • 問い合わせ時の回答が分かりやすいか
  • 無料終了後の料金・解約条件を確認したか

無料トライアルは管理部門だけで試さず、パート、営業、店舗責任者など、働き方やITスキルが異なる人にも打刻・申請を試してもらうのがおすすめです。現場が迷った部分を記録しておけば、本番導入時のマニュアル作成にも使えます。

勤怠管理システム導入の5ステップ

勤怠管理システムを比較してテスト運用から本番移行する5ステップ
  1. 現在の勤怠業務を整理する
    打刻、申請、承認、集計、給与連携を一覧にします。
  2. 候補を2〜3製品へ絞る
    勤務形態、人数、必要機能、予算を基準にします。
  3. 実際のルールで試す
    通常勤務だけでなく、残業、休暇、休日出勤、打刻漏れも登録します。
  4. 1回の締め処理を比較する
    現在のExcelやタイムカードと集計結果を比較します。
  5. 切替日と旧データの保管方法を決める
    新旧2つの仕組みへの二重入力を長期間続けないようにします。

勤怠以外も含めてバックオフィスのExcel管理を見直したい方は、バックオフィス向け脱Excelツール3選も参考にしてください。

勤怠管理システムに関するよくある質問

中小企業でも勤怠管理システムは必要ですか?

従業員が少なく、勤務形態が単純で、現在の勤怠締めに困っていなければ、すぐに有料システムへ移行する必要はありません。

人数が少なくても、シフト、夜勤、直行直帰、残業申請、給与転記などが増えているなら、クラウド化する効果が大きくなる場合があります。

無料の勤怠管理システムだけでも使えますか?

出退勤と基本集計だけなら無料プランで足りる会社もあります。

有給休暇、申請承認、シフト、給与連携、データ保存、サポートまで必要になると有料機能が必要になる場合があります。

勤怠管理システムの料金相場はいくらですか?

今回比較した人数課金型では、1人月額100〜500円程度の製品があります。

ただし、基本料金、最低利用料金、初期費用、端末、オプション、導入支援によって実際の総額は変わります。

給与ソフトと同じ会社の勤怠を選ぶべきですか?

必ず同じ会社にする必要はありません。

ただし、従業員情報や勤怠実績を直接連携できれば、CSV加工や二重入力を減らしやすくなります。

別会社の製品を選ぶ場合は、現在の給与ソフトへ必要項目をCSVなどで渡せるか確認してください。

システムを導入すれば給与計算ミスはなくなりますか?

システムを入れただけではなくなりません。

勤務区分、休憩、残業、休日、休暇などの設定が間違っていれば、システムも間違った結果を計算します。

本番開始前に現在の集計結果と比較し、設定内容を検証してください。

まとめ|勤怠管理システムは料金より業務フローで選ぶ

中小企業向けの勤怠管理システムは、単純な人気ランキングでは選べません。

勤務形態、例外処理、申請承認、給与計算までの流れに合う製品を選ぶことが重要です。

  • 30名以下の基本勤怠を無料から:HRMOS勤怠
  • 直行直帰・交通費・日報:Relix勤怠
  • 複雑な勤務制度・複数拠点:KING OF TIME
  • 必要機能だけ選択:ジョブカン勤怠管理
  • 勤怠と給与を接続:freee勤怠管理
  • バックオフィス全体を統合:マネーフォワード
  • 人事情報と一元管理:ジンジャー勤怠

現在Excelで問題なく運用できているなら、無理に有料システムへ移行する必要はありません。

一方、打刻漏れの確認、給与ソフトへの転記、シフト変更、有給管理などへ毎月時間を使っているなら、月額料金だけでなく削減できる人件費も比較してください。

特に現場勤務や直行直帰が多く、交通費や日報もまとめたい会社であれば、Relix勤怠は比較候補に入れやすい製品です。

登録月と翌月の無料期間を使い、実際の従業員と勤務ルールで、打刻から月末締めまで確認してから判断してください。

\ 月末締めまで自社で使えるか確認 /

料金、無料期間、機能、契約条件は変更される可能性があります。最新情報は遷移先の公式画面で確認してください。


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